Administrativ topfigur i provinsen Slesvig-Holsten var overpræsidenten, der repræsenterede den højeste statsmyndighed og formulerede den overordnede politik for forvaltningen.
Den egentlige sagsbehandling blev foretaget af Den Kongelige Regering i Slesvig, og i den daglige administration blev overpræsidenten mest et gennemgangsled mellem regeringen og ministerierne i Berlin, i første række det preussiske indenrigsministerium.
Den blev ledet af en regeringspræsident og bestod af tre afdelinger: Indre forvaltning, medicinal-, kirke- og skolevæsen samt finansforvaltning.
Størstedelen af regeringens arkiv findes i Landesarchiv Schleswig-Holstein (Abt. 309) i Slesvig by. En fortegnelse over gruppenumre og et alfabetisk sagsregister hertil findes som kopi på Landsarkivet for Sønderjylland.
Overpræsidentens fuldstændige arkiv (Abt. 301) findes på Landesarchiv Schleswig-Holstein, og det samme gør de kortvarige overgangsmyndigheders arkiver 1918-1920 (Abt. 59-62). Overpræsidentens arkiv fylder 239 hyldemeter og rummer 7.456 aktnumre. Af særlig interesse for Sønderjyllands politiske historie er akterne vedr. "Nordschleswig-Politik", der bl.a. rummer sager om udvisninger, den danske bevægelse i Nordslesvig, understøttelsen af det tyske arbejde og den rigsdanske nordslesvigpolitik med bl.a. udklip fra danske aviser.
En trykt registratur til overpræsidentens arkiv findes hos Landsarkivet for Sønderjylland.
I landsarkivets bibliotek findes endvidere regeringens meddelelsestidende, Amtsblatt der königlichen Regierung zu Schleswig.
En lille del af regeringspræsidentens arkiver ligger på Landsarkivet for Sønderjylland, navnlig medicinalsager (visitation af apoteker, jordemødrenes embede og vaccinationsvæsenet) og trafiksager (lodsvæsenet ved Lillebælt, vedligeholdelsen af statsveje i Aabenraa og Sønderborg amter, anlæggelsen af Tønder-Tinglev-jernbanen) samt nogle sager om stiftelser og salget af Haderslev Dam. Mest materiale har landsarkivet fra kontorerne III c (Forstbureau) og III d (Katasterbureau).